国六年七月，孙中山南下护法，在广州成立军政府，徐应孙之邀，由沪至穗，共同护法。
    一九二三年二月二十三日，孙发布大元帅命令：“桂军总司令沈鸿英着将所率全部移驻肇庆，所遗北江一带防地，着滇军总司令杨希闵迅即派队接防，西路讨贼军总司令刘震寰所部，着驻石门、东莞、虎门各地；东路讨贼军第四师长石春荣所部移驻罗定等地，此外各部队，就现在地点驻扎，自经此规定后，各部军队非奉本大元帅命令，不得擅自移动，致滋纷扰。”
    大本营成立后，孙首先致力于裁兵工作。先调查各军实数，限于三月二十日前，将该军营数和驻扎地点，造具军官姓名、履历及兵士名册，呈报大元帅府。由大元帅派员分赴各军驻在地，逐一点验，倘有虚额不准再招，而老弱无枪支者，则一律裁汰。
    三月二十日孙发表“裁兵之重要与处置方法。”
    孙此番回粤，对外方面则力求西南各省步调一致，几经磋商，乃与唐继尧、刘成勋、熊成武、赵恒惕、谭延闿、刘显世等西南领袖联名通电，宣告对西南时局之意见。
    内称：“我西南各省，决以推诚相见，共议图存，弃前事之小嫌，开新元之结合。分灾恤患，载之简书，外间内谗，一切勿受。兵为防守，不为争夺，
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