民国高官于右任、邵力子为其弟子。后人辑有《马相伯先生文集》。
    此时，张元济在南洋公学任译书院院长，蔡元培常向自己这位同科好友借阅西学书籍和日文资料。来往多了，他们之间的关系更为密切和志同道合，不时彻夜长谈。
    二人商定：合资创办一份报纸，专门向国人译述外国报刊对中国的评论和报道，初名为《开先报》，后改称《外交报》。
    蔡元培为该报撰写《叙例》，阐明办报宗旨：“荟我国自治之节度，外交之政策，与外国所以对我国之现状、之隐情，胪举而博译之，将以定言论之界，而树思想之的。”
    此报于1901年10月发刊，张元济为主编，蔡元培负责撰写论说、翻译日文稿件。
    不久，张元济投资商务印书馆，并向该馆主办人夏瑞芳建议设立编译所，以拓展事业。
    翌年，编译所成立，张元济推举蔡元培兼任所长，负责组织编写新式学校的各类教科书。
    蔡元培积数年的办学经验，详细制定了编撰体例，并邀请蒋维乔等担任编撰，这便开始了蔡元培与商务印书馆长达几十年的合作。
    在此期间，蔡元培编选的三卷本《文变》一书，由商务印书馆发行。
    此书选入文章四十二篇，
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