全校二百多名学生的强烈不满，大家相约全体退学。
    蔡元培同情学生，曾向学校当局交涉，希望能改变无理的决定。但有人说学生此举就是因为他平素提倡民权思想所致，在此情况下，蔡元培只能愤然辞职。
    随后他将一部分退学的学生组织起来，征得中国教育会同人的赞同和支持后， 募集款项，聘用义务教员，创办起了爱国学社。
    他被推举为学社的总理。也就是校长，该学于1903年初正式开学。
    爱国学校的成立，是蔡元培为新教育奔波多年之后，相对独立创办起来的一个教学实体。在这里，他总算可以自主的贯彻自己的教育救国主张了。
    而随着一批反清志士的加入和客观形势的推动，蔡元培这位儒者也就开始了革命的生涯。
    20世纪初的上海。作为中国近代发展最快的通都大邑，常能独得风气之先。十里洋场本就鱼龙混杂，信息灵便。 戊戌变法失败后，国内很多仁人志士聚集于此各展宏图。海外反清力量于庚子事变之后气势也越来越强盛，凭借沪上的租界，联络同志，开展活动。
    这一时期，忧国的中国精英分子们纷纷走上了暴力推翻满清政权的道路，革命成为风尚。
    这些志士们都以为，非颠覆满清政权
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