礼文岛各处都可看到安山岩、玄武岩的柱状节理以岩脉的形式出现。另外礼文岛还产出化石和燧石。
    礼文岛上生存有日本歌鸲、红喉歌鸲、日本树莺、苍眉蝗莺、北蝗莺等鸟类，久种湖附近有时可以看见牛背鹭、大田鹬、小辫鸻、戴胜等鸟类。海岸地区生存有暗绿背鸬鹚、黑尾鸥、灰背鸥。
    在哺乳动物方面，岛上没有棕熊、虾夷鹿、狐狸，但生存有日本鼬（移入种）、花栗鼠、谷地鼠、鼩鼱、蝙蝠。
    以前还生存有虾夷栗鼠、小飞鼠、日本伶鼬、日本水獭、日本海狮、领航鲸，但已经灭绝。礼文岛过去曾是日本海狮的生息地之一，自绳文时代开始，在礼文岛就有狩猎水獭的活动。
    1974年，有人在礼文岛目击到日本水獭出现，这也是除了竹岛（韩国称独岛）的目击记录之外之外最后的日本水獭目击记录。
    另外，该岛和千叶县也是日本国内仅有的两个出土过领航鲸的地区。在礼文岛栖息的鳍足类动物则有北海狮和斑海豹。
    虽然北海狮被日本环境省指定为濒危动物，但由于会造成渔业损害，当地人时有捕杀北海狮。
    礼文岛现在已很少能看到鲸鱼类出现，但有时仍能确认到小须鲸、贝氏喙鲸、史氏中喙鲸、虎鲸
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