代明统治中国后为了防止此类事情的再次发生，对蒙古实行了一系列的政策。比如旗界封闭制度，众建以分其力。蒙古共被分为了200多个盟和旗，始终被束缚在各自的地域，不相统属，不能统一在一起，同时，禁止蒙古人学习和接触汉文化。从而使蒙古人民无法获得汉族先进的生产技术和生产工具，始终处于游牧的地位，三百年不能进一步的发展。最毒的是喇嘛教政策，崇释以制其生。满清利用喇嘛教以统治蒙古人民，凡有兄弟八人者，七人须当喇嘛；兄弟五人者，四人须当喇嘛；仅有一人可为娶妻生子的平民。而喇嘛是不能娶妻的，长此以往，人口必然下降。以至于蒙古在明灭时本有一千二百万人，至了光绪时期仅五十余万人。

    这个政策也逼得蒙古也中央朝廷离心离得，这也是乌泰起兵能有巨大影响的原因。但自从乌泰兵败，叛乱者被屠杀一空后，蒙古草原上的各旗各部族长、王公贵族被一旨全部宣进京城。就在皇上迎娶乌泰之女琪木格为皇贵妃的当天，朝廷颁下旨意，彻底废除旗界封闭制度与喇嘛教政策。要求有还俗意原的男子可以随时还俗，宗教不得干涉。同时，宰相大人提出每年定量采购牛羊等肉食，兵部提出由朝廷出资出饷，由蒙古人出马组建骑兵等等一系列的政策。结果让这些还心
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