让蔡复一以兵部右侍郎巡抚贵州，总督湖广、云南、贵州等地军务，后来见匪情紧急又给朱燮元加兵部侍郎衔，总督四川、湖广、贵州军务。由于蔡复一和朱燮元两人职责上有重复，造成后来的水西战败，因此天启不想再发生这类事。

    上半年朝廷改制，废除原来的布政使等职务，总督、巡抚等流动官员改为每省的固定官员，并且规定不许加虚衔，当时皮岛总兵毛文龙在天启的暗示下带头去掉自己头上的一品将军虚衔，其他人不得已也遵从朝廷命令去掉虚衔各领一省。天启也没有亏待他们，私下下旨说只要他们遵从朝廷谕令，将来每人都会根据功劳得到荫封职位。荫封职位就是给后代子孙搏得一个铁饭碗，大名鼎鼎的戚继光就是继承的荫封职位，对此大家还是比较满意的。

    在总督、巡抚成为固定官职后，蔡复一为云南总督兼任广西总督，在南方主守势，朱燮元为贵州总督兼四川、湖广总督，由北向南主攻。让这两人兼职的目的是为了方便统筹安排，避免再出现权力空白或是权力重复互相掣肘。现在改变策略要两人都取守势，而由张静安和赵率教来主攻平叛，想让两人刚柔相济达到一劳永逸的结果。为了避免外来军队与原来军队之间出现不服从指挥的情况，天启准备派人去坐镇，并想在
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